সঠিক মাতৃগাছ নির্বাচন, সংগ্রহ, রক্ষণাবেক্ষণ ও বংশবিস্তার, ফলের উৎপদন বৃদ্ধির জন্য অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ। সংগৃহীত ফলগাছের চারটি যাতে উচ্চফলনশীল এবং অবিকল কাঙ্খিত মাতৃগাছের গুণাগুণ সম্পন্ন হয় সেজন্য প্রথমে মাতৃগাছ চিহ্নিত করতে হবে এবং মার্তৃগাছের বাগান স্থাপন করতে হবে। কেননা একজন ক্রেতার পক্ষে ফলগাছেরচারা /কলম ক্রয় করার সময় যে বিষয়গুলি বিবেচনায় নেয়া জরুরি, তা হলোঃ চারা /কলমটি কাঙিক্ষত জাতের মাতৃগাছ থেকে উৎপাদিত কিনা? নির্বাচিত কলম/চারাটি অবশ্যই অঙ্গজ উপায়ে উৎপাদিত এবং গুণগতভাবে হুবহু কাঙ্খিত জাতের মাতৃগাছের মত হতে হবে। কেননা বীজ থেকে উৎপাদিত ফলের চারা গুণাগুণ এর দিক থেকে কখনও সম্পূর্ণ মাতৃগাছের মত হয় না। মাতৃগাছটি উপযুক্ত কিনা? চারা সংগ্রহ ফলগাছের চারা উৎপাদনের জন্য কাঙ্খিত গুণাগুণসম্পন্ন , রোগবালাই ও পোকা মাকড়ের আক্রমণমুক্ত মাতৃগাছ নির্বাচন করা অপরিহার্য। ভাল মাতৃগাছ ছাড়া ভাল কলম উৎপাদন করা সম্ভব হবে না। যেমন আমের ক্ষেত্রে ম্যালফরমেশন ও এ্যানথ্রাকনোজ, পেয়ারার ক্ষেত্রে এ্যানথ্রাকনোজ দ্বারা আক্রান্ত চারা/কলম কোন ভাবেই রোপনের জন্য সংগ্রহ করা উচিত নয়।